大屠杀前，海德里希将特别行动队的 120名大小头目集中，训练屠杀技能。希姆莱作了秘密指示，对于犹太人等波兰、俄罗斯和乌克兰的两亿东方“劣等民族”，“要在战场上一个一个地予以全部消灭”。海德里希还集中3000多全部队员，作了屠杀前的总动员。

　　在本世纪苏联犹太人历史上，先后发生过沙皇、乌克兰白军大头目彼得留拉策划的大屠犹，仅仅过去二三十年，一场更空前的大屠杀又已降临。

　　首先，陆军将占领地的人民集中围起来，交给特别行动队甄别“处理”。或者，陆军杀到一地，立即颁令所有的犹太人佩带上六角形的“大卫星”标志，以便特别行动队快速辨捕屠杀。

　　首当其冲的是立陶宛考纳斯市附近的边境村庄维堡里斯。人们被一批批地赶到德军甄别小组前，几百名被当地立陶宛帮凶拖来的犹太人直接放到一边。未带证件者或苏维埃干部立即被推到树林后面枪毙。“甄别”完后犹太人被赶到树林背后。二公里长的反坦克沟成为天然“死亡坑”，屠杀者逼着几十名犹太村民跳入沟中，由一名机枪手顺着沟沿边走边扫射。这天一共扫射了六批犹太人。最后沟边剩下四个几岁的犹太幼儿，四个屠杀者放下枪，抓起小孩的腿在大石头上砸碎了他们的脑袋。

　　拉脱维亚的德温斯克有 16000名犹太人，德军先欺骗说16～60岁的男人报到参加废墟清理，缺乏对德国种族灭绝意图了解的犹太人毫不迟疑地去了。夜间他们被分批枪决，凌晨时分尸体推入城外的万人坑中。

　　9 月27日凌晨，德军攻入处于波兰东部边境的比亚利斯克市，该市犹太区含西部逃来的犹太人共 5万多人。八点钟屠犹开始，犹太人被挨家挨户赶出来，稍有挣扎者立即被处决。大部分被赶往犹太人大会堂。会堂先塞进 800多人，然后点火焚烧，再不断赶人走入烈火熊熊的会堂。会堂附近的房屋开始燃烧，德军不住地往没燃的房子

　　扔手榴弹。很快这个由木制房屋组成的犹太区成为一片火海，全城弥漫着尸臭。一天之中，德军烧杀了2000多名犹太人。

　　在诺沃格罗代克镇，德军先要求犹太人派50名志愿者到新设立的“犹太委员会”工作，想活命的人们争先恐后地报名。一支行刑队在镇外一个砖瓦厂里等候第一批从德军司令部用卡车送来的“志愿者”。接着又是第二批……这种方式采用到犹太人明白是屠杀的骗局为止。

　　屠杀每天都在各地“有秩序地”进行，地点往往是苏军退却前挖的反坦克壕。 7月初在乌克兰利沃夫市郊外。一群衣服被扒光的犹太妇女挤在一起发抖，被一伙乌克兰籍的特别行动队员围在中间。这些乌克兰帮凶并不准备遵守“不准与犹太女人性交”的禁令，先将妇女强奸，包括一名13岁的少女，然后再将她们击毙。

　　“上帝的选民”们逐渐弄清楚了自犹太先祖雅各以来四千年古老历史上未曾有过的悲剧命运之后，沉默地走向屠场引颈就戮，刽子手有条不紊地“落刀”。屠场上只听到枪声和沉闷的步伐。

　　正如早逝的犹太写作者卡夫卡在一篇小说中预言般的写过的，一架性能优良、只需按一个电钮就将人切成碎片的杀人机器，屠杀过程改进成最简单、迅捷的流水线方式。次日要枪毙的人先挖好“死亡坑”，一批批的犹太人自己趴到沟里，特别行动队照准他们的后脑勺射击。

　　10月 5日乌克兰杜布诺镇，目击者德国工程师赫尔曼·格瑞比特看到：卡车送来的犹太男人、女人和孩子无言地脱掉衣服，按外衣、内衣、鞋和帽子分别推放，其中鞋堆足有上千双。然后一家人一家人互相拥抱吻别。一个八口之家，有祖母，50多岁的夫妇和一二十岁的五个孩子，满头银发的祖母抱着一周岁的小孙子唱起一支犹太古歌。低声细语的告别后，20多个赤裸的犹太人被枪托点出走进大坑，其中一位黑头发的漂亮姑娘指着自己对格瑞比特说：“请记住，我才23岁。”

　　坑中已装满2／3，足有1000多人。走进去的人摸摸未断气同胞的脑袋，说一两句鼓励的话，然后扫射开始。屠杀持续一天一夜，目击者格瑞比特称，他没有看到一个刽子手有过丝毫犹豫的表现。

　　巴贝亚尔沟是苏联地区最大的一个屠场，它是乌克兰首府基辅市郊的一条雨水冲刷出的深沟。在德军占领基辅的两年时间里，巴贝亚尔沟里枪杀了十余万当地人民，其中三万多是犹太人。

　　9 月27日起德国人命令基辅市犹太人到指定地点集中以便进行重新安置。结果几乎所有的犹太人都赶来报到。屠杀由特别行动队C 支队执行。两行荷枪实弹的乌克兰警察将人们夹送至主沟前，特别行动队命令所有的人脱光衣服，100人100人地走入沟中，乌克兰警察用枪托和刺刀逼着人们往前走，若是幼儿就提起小腿往沟里扔。沟中挤满人后，机枪齐鸣，沟中立即积起一尺深的鲜血……屠杀持续了两天，就将 33771名犹太人全部杀死。

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