A400M的座舱极为现代化，采用源自于A380客机的整合式航电设备。座舱内总共配备有9个6×6英寸的液晶显控屏幕，实现了座舱内操控的高度自动化。座舱内配备两名机组人员，必要时可多搭载一名人员，负责某些特定任务的操作。与现有的新型空中客车飞机一样，A400M采用线传飞控系统操作，飞机主要是由计算机来控制飞行。座舱内还配备完善的导航与飞航控制设备，像是惯性导航系统、全球定位系统、导航着陆系统、无线测距仪、航空控制仪、自动寻标仪、战术航空组件等。