A400M采用先进的结构设计与较高比重的复合材料来制造，大幅降低了飞机的重量。同时，A400M设计师还特别加强飞机的作战生存性，包括机身重要部位的装甲防护装置、防弹玻璃窗、发动机红外热讯号抑制技术、燃油系统中的惰性气体抗燃爆技术等。此外，机上还配备有防卫辅助设备，包括雷达警告器、导弹发射警告器、诱饵发射装置等。另外，在机翼还设置有结构加固点，以便于安装电子战设备，提升飞机的生存性。