据日本共同社20日报道，日本防卫省和太平洋美军情报机构，搜集了中国和俄罗斯等邻国潜艇在事发前后的动向，并在美国海军协助下展开调查后认为，事发海域“几乎没有别国潜艇进入的任何可能性”。倒是足折岬海域和土佐湾一带是著名的鲸鱼生息地，所以日美开始倾向认为，可能是自卫队误将鲸鱼鳍当成了潜望镜。当然，这一说法也没找到确切证据，所以，日本自卫队调查人员闪烁其辞地说，这“或许将永远成为一个谜”。