2000年10月，陈水扁、张俊雄在未经广泛论证的情况下，擅自作出决定，停建早已由政府通过的第四核电厂的兴建工程，从而在台岛内引起了一场"核四风波"。在这场风波中，以连战、宋楚瑜为首的在野党联盟向陈水扁发起了猛烈的进攻，情急之下，四面楚歌的陈水扁向当时刚刚被留任的伪"国防部长"伍世文求救，希望他能出面从军事角度阐述一下"核四"工程的危害。出人意料的是，一向标榜"军人不问政治"的伍世文居然站出来就"核四"问题发表了一番高论，更出人意料的是，伍世文居然表示，"基于军事立场，“核四”应继续兴建"，一时间，台湾媒体为之哗然，称陈水扁"自摆乌龙"。

　　伍世文在发言中说，自"国府"迁台以来，台湾从来没能真正挥别战争的阴影。蒋经国时代搞的十大建设，设计中许多地方都融入了战略、战备因素。例如，高速公路规划了飞机战备跑道，北回铁路的宽度是以可载运重型战车通过为基准。评估核四兴建得失，军事与安全考量不可缺席。为了确保战时能量供应，军方支持核能发电政策，核四厂一旦建成，其"终极破坏"作用对大陆也是一个巨大的威慑。

　　伍世文强调，一旦两岸发生军事冲突，海上封锁和导弹攻击是大陆可能的优先选项。目前台岛的电力供应，水力发电只为陪衬，火力发电必须仰赖石油、燃烧与天然气等能源。按军方研究律定的战备物资储备计划，为因应大陆的海上封锁，上述战备物资的存量，均应维持四个月左右。但由于台岛地方较小，平时储备根本达不到要求。因此，我方必须强化核能发电比重，以备战时之需。如核能成为战时主要电力来源，我方就有机会力撑待援，以时间换取空间，此其一也。其二，兴建“核四”还可以强化"终极破坏"筹码，意指大陆若敢对台核电设施进行空中攻击，势必造成严重辐射污染。届时，辐射尘会飘向大陆、东南亚、日本和朝鲜半岛，鉴于美国三里岛、前苏联切尔诺贝利核电事故所造成的灾害，大陆难以犯此禁忌。

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