台湾“国防部”3月20日召开三军总司令及各军种将领会议。由于军中干部大多为国民党籍，对于陈水扁当选都有无法 接受的感觉，因此如何纾解军中不安的情绪成为会议的重点。此次高层会议由“国防部长”唐飞主持，会议的重点除了由相关 单位提报大陆的军事情势、军方维护宪法与效忠“新总统”外，如何纾解军中情绪也是讨论的重点。对于国民党的失利，许多 军官与“国民党中央党部”前抗议的群众一样无法接受，许多人准备「上报告退伍」。