台湾当局新军事战略中还在争议的部分，主要在于是否放弃对大陆近岸的攻击能力。李登辉和陈水扁时代，台湾当局组装和引进了用于攻击大陆的一系列武器系统。主要有雄风2E巡航导弹，短、中程弹道导弹、F-16战机等。这些武器的攻击半径接近1000公里，可以威胁大陆沿海军事基地和上海至香港一线的沿海城市。