有分析称，进入21世纪后，日本自卫队内部要求重新反思东京审判、改变军队地位的呼声就日益高涨，只不过，过去这些声音仅限于“内部交流”，而像此次这般外溢到整个社会实属鲜见。如果进一步的调查证明这是自卫队由上而下有组织的集体行动，那么此次事件足以证明日本战后的“文官统治”已受到严重威胁。

　　在日语中有一个词叫做“暴走”，意指那些不计后果的莽撞行为。而最近一年多以来防卫省和自卫队的“暴走”简直成了执政党的一大麻烦策源地。先后执政的安倍晋三、福田康夫和麻生太郎皆吃尽苦头。但无论是之前的防相久间章生“失言”、防务次官守屋武昌贪污受贿，还是军舰撞渔船、机密被泄露，没有哪一个丑闻像此次事件般令整个防卫省和自卫队的组织体系、教育体系都面临根本性的信誉危机。

　　为此，日本防卫大臣滨田靖一于11月10日下午在防卫省向全军干部训话：“包括历史观在内，持有稳妥的见解以及对自身行动所带来影响的审慎判断力对干部而言，乃是大前提”，“倘若再出现此类事件，国民对自卫队的信赖很可能从根本上迅速崩溃”。

　　麻生政府从一开始就意识到了“论文门”的严重性。10月31日白天，防卫省防卫事务次官增田好平看到论文后立即向还在外地的防相滨田靖一报告，随后首相麻生也收到了相关报道。当晚，趁在野党还没来得及发难之际，滨田宣布罢免田母神的航空幕僚长一职。4日，麻生将滨田靖一、增田好平召至首相官邸。当天下午，防卫省宣布，滨田防相被勒令向国库退回一个月的薪水，增田好平事务次官也遭减薪待遇，另有5名防卫高官分别受警告处分或向国库退回半个月工资的惩罚。

　　比起原防卫大臣久间章生“失言”后安倍内阁表现出的举棋不定，麻生内阁的动作不可谓不迅捷果断。这些动作也的确缓解了民众对政府的不满，也没有激起中国、韩国等邻国民众的过度愤慨。但这并不等于，难题已经解决，危机已经过去。

　　田母神的航空幕僚长头衔虽然被罢免，但其“航空将军”的军衔依然有效。因此按照相关规定在被勒令退休后，他依然能够领取高达6000万日元的退休金。这一事实被媒体曝光后立即招徕舆论不满。尽管滨田靖一希望田母神能主动退回退休金，但脱了军装的田母神不仅拒绝承认自己的言论有不妥之处，更拒绝交出退休金。

　　一直对自民党执政地位虎视眈眈的在野党自然不会轻易放弃机会。他们群起而攻之：既然田母神以往就有过激言论，为何还能被擢升至航空自卫队的最高长官？代表国民对自卫队行使最高指挥权的首相无疑有不可推卸的责任。

　　在日华人学者刘迪认为，在解散众院、举行大选已是大势所趋的此时，“论文门”事件毫无疑问令前途未卜的麻生政权雪上加霜。再加上美国大选刚刚尘埃落定，日美关系前景尚难预料，而田母神的“珍珠港之战是日本中了美国圈套”的言论，山姆大叔岂会不以为意？再者，中日韩三国领导人会议下月即将在麻生的老家福冈举行。上任以来一直对中、韩两国推行积极外交的麻生如果对此次事件处理不力，到时又将以何面目去见中韩领导人。

　　面对强硬的田母神和纠缠不清的“论文门”事件，内政外交都要求麻生政府想出更好的对策。可以说，对麻生的考验还在后面。

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